MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 7206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017167	GTTGT	2	10	560459	560468	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017167	CGTT	2	8	560472	560479	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_017167	CTC	2	6	560480	560485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_017167	CGG	2	6	560562	560567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_017167	TCC	2	6	561081	561086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_017167	AG	3	6	561698	561703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017167	GGGC	2	8	561719	561726	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_017167	AGCC	2	8	561952	561959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_017167	CGG	2	6	561989	561994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_017167	AGG	2	6	562020	562025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017167	GCAC	2	8	562043	562050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_017167	GAA	2	6	562057	562062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017167	CA	3	6	562077	562082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_017167	GGT	2	6	563220	563225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017167	GCG	2	6	563886	563891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017167	T	7	7	563921	563927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017167	GCTGG	2	10	563932	563941	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1518	NC_017167	GGC	2	6	564015	564020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_017167	AGG	2	6	564041	564046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017167	CTG	2	6	567305	567310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017167	GT	3	6	567315	567320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017167	GGTT	2	8	567372	567379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017167	CGC	3	9	567846	567854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_017167	T	6	6	567872	567877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017167	GC	3	6	567912	567917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_017167	TCC	2	6	570350	570355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_017167	TTC	2	6	570480	570485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017167	TC	4	8	570493	570500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_017167	GGAG	2	8	576850	576857	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017167	CCG	2	6	577480	577485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_017167	G	10	10	580645	580654	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017167	TGT	2	6	580687	580692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017167	GCC	2	6	580735	580740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_017167	GCT	2	6	580741	580746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017167	GGC	2	6	580754	580759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017167	GGGAA	2	10	582034	582043	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017167	TGA	2	6	583075	583080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017167	AGG	2	6	583635	583640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017167	CGG	2	6	585053	585058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017167	G	6	6	585074	585079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017167	CGG	2	6	586538	586543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017167	GTGCC	2	10	586550	586559	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1543	NC_017167	AGG	2	6	588396	588401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017167	GCTG	2	8	590106	590113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_017167	CGG	2	6	591572	591577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_017167	AGG	2	6	591639	591644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017167	GGC	2	6	591682	591687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017167	G	6	6	591720	591725	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017167	AGCA	2	8	591726	591733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_017167	TGC	2	6	591748	591753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_017167	CGG	2	6	591789	591794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_017167	CGGG	2	8	591833	591840	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_017167	CGC	3	9	591904	591912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_017167	GCGG	2	8	591942	591949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_017167	TGA	2	6	593092	593097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017167	CCG	2	6	593908	593913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_017167	GTGA	2	8	593991	593998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017167	GAG	2	6	595030	595035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017167	GCC	2	6	595545	595550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_017167	AAT	2	6	600490	600495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017167	TCG	2	6	600499	600504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017167	CCA	2	6	600595	600600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_017167	CTC	2	6	601310	601315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_017167	GCC	2	6	601325	601330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_017167	GAA	2	6	601359	601364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017167	TCCATG	2	12	602917	602928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017167	CGG	2	6	602934	602939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_017167	GCT	2	6	602989	602994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_017167	CCT	2	6	603016	603021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_017167	TCAC	2	8	603023	603030	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_017167	AGG	2	6	604979	604984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017167	GA	3	6	604985	604990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017167	AAG	2	6	607607	607612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017167	TTGT	2	8	607666	607673	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017167	CAT	2	6	607690	607695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_017167	A	6	6	608878	608883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017167	TGTT	2	8	609625	609632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017167	GCGTG	2	10	609658	609667	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1579	NC_017167	GGT	2	6	609726	609731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017167	GCG	2	6	609776	609781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_017167	ACA	2	6	609790	609795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_017167	CTCGG	2	10	610493	610502	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1583	NC_017167	AGC	2	6	610561	610566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017167	GGGA	2	8	610600	610607	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017167	GC	3	6	611272	611277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_017167	AGA	2	6	611278	611283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_017167	TAC	2	6	612834	612839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_017167	ATCT	2	8	612842	612849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_017167	GGGA	2	8	615667	615674	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017167	AG	3	6	617518	617523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017167	TTC	2	6	620668	620673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_017167	TCG	2	6	620680	620685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_017167	GCC	2	6	620694	620699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_017167	AGA	2	6	620716	620721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017167	A	6	6	620721	620726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017167	GA	3	6	620728	620733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017167	GGA	3	9	620735	620743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017167	ACC	2	6	623676	623681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_017167	GC	3	6	625046	625051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_017167	CAT	2	6	625094	625099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017167	AGG	2	6	625134	625139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017167	TAT	2	6	627412	627417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017167	ACC	2	6	629402	629407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_017167	CG	3	6	629419	629424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_017167	GC	3	6	629646	629651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_017167	CCG	2	6	629694	629699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_017167	GGA	2	6	632676	632681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017167	GCC	2	6	633262	633267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_017167	GC	3	6	634762	634767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_017167	CGC	2	6	634854	634859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_017167	AGG	2	6	634863	634868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017167	TGCTT	2	10	634907	634916	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_017167	GC	3	6	634950	634955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_017167	ATC	2	6	634986	634991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_017167	GC	3	6	635006	635011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_017167	TCG	2	6	635072	635077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017167	G	7	7	635087	635093	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017167	CGC	2	6	635094	635099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_017167	CGA	2	6	635139	635144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_017167	GAT	2	6	638983	638988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017167	CTG	2	6	640009	640014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_017167	CGC	2	6	640017	640022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_017167	TTG	3	9	640048	640056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017167	GC	3	6	640112	640117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_017167	CG	3	6	640122	640127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_017167	CTCG	2	8	642262	642269	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_017167	TGT	2	6	642306	642311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017167	CGCC	2	8	644336	644343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1630	NC_017167	CTC	2	6	645281	645286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_017167	TGCG	2	8	647323	647330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_017167	CAA	2	6	647333	647338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_017167	TCC	2	6	647344	647349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_017167	GCG	2	6	647351	647356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1636	NC_017167	GAC	2	6	647386	647391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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